违章建筑法院的处理方式如下：
1、违章建筑的认定是指违反法律、法规，在城市规划区内没有取得建设工程规划许可证或者违反工程规划许可证的规定建设的建筑，或者是采取欺骗手段骗取批准而新建、扩建或改建的建筑；
2、违章建筑应由县级以上人民政府土地行政主管部门责令处分处罚；
3、违规建房可以强拆；
4、城乡规划主管部门作出责令停止建设或者限期拆除的决定后，当事人不停止建设或者逾期不拆除的，建设工程所在地县级以上人民政府可以责成相关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施的决定。
违章建筑的主要表现形式：
1、未经批准、无证建造且政府已出面制止，确属违章建筑的；
2、相关法律出台前已建成的建筑物，不存在合法或者违法之说，法律出台后未办证，相关政府部门也未要求办证；
3、确实无证、客观上属于违章建筑，但在建造过程中当事人主观上不知道是违法；
4、当事人建成的建筑物系违章建筑，但政府亦违法，不给办证甚至连答复都不给；
5、当事人建成的建筑物系违章建筑，但是政府默许；
6、通过受让取得他人的违章建筑；
7、棚户区；
8、政府拆迁征收时违法吊销当事人证照造成事实上的违章建筑。
综上所述，违章建筑的结果就是可能会被强拆，所以我们在修房子的时候一定要了解相关的知识，不然房子完工之后不仅会对被强拆，而且自己的生活也可能因为房子的事情弄的一团乱，最后还是自己承受损失。
【法律依据】：
《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条
未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；
尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；
无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。