新农合的报销流程如下：
1、由门诊医生或住院部医生诊断，开具住院证；
2、持农合证到住院收费窗口缴费并做网络登记；
3、持住院证，缴款单到住院登记窗口登记，领取病历表及用品；
4、到对口专科进行住院检查、治疗；
5、出院时找自己的主管医师开具出院证、诊断证等。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十四条
国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
第二十五条
国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。
城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。
享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。
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